Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSC3Q14574 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DSC3Q14574 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms