Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM25Q14258 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms