Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
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SHROOM2Q13796 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SHROOM2Q13796 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
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SHROOM2Q13796 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
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SHROOM2Q13796 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
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SHROOM2Q13796 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
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SHROOM2Q13796 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
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SHROOM2Q13796 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SHROOM2Q13796 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
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