Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOFQ13790 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOFQ13790 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOFQ13790 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOFQ13790 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOFQ13790 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOFQ13790 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOFQ13790 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOFQ13790 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOFQ13790 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOFQ13790 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOFQ13790 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOFQ13790 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOFQ13790 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOFQ13790 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOFQ13790 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOFQ13790 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOFQ13790 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOFQ13790 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOFQ13790 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOFQ13790 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOFQ13790 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOFQ13790 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOFQ13790 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOFQ13790 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOFQ13790 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOFQ13790 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOFQ13790 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOFQ13790 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOFQ13790 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOFQ13790 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOFQ13790 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOFQ13790 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOFQ13790 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOFQ13790 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOFQ13790 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOFQ13790 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOFQ13790 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOFQ13790 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOFQ13790 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOFQ13790 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOFQ13790 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOFQ13790 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOFQ13790 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOFQ13790 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms