Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SP140Q13342 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SP140Q13342 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SP140Q13342 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SP140Q13342 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SP140Q13342 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SP140Q13342 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SP140Q13342 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SP140Q13342 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SP140Q13342 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SP140Q13342 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SP140Q13342 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SP140Q13342 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SP140Q13342 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SP140Q13342 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SP140Q13342 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SP140Q13342 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SP140Q13342 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SP140Q13342 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SP140Q13342 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SP140Q13342 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SP140Q13342 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SP140Q13342 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP140Q13342 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP140Q13342 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP140Q13342 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP140Q13342 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP140Q13342 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP140Q13342 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP140Q13342 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP140Q13342 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP140Q13342 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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SP140Q13342 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP140Q13342 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP140Q13342 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SP140Q13342 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP140Q13342 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP140Q13342 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP140Q13342 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
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SP140Q13342 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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SP140Q13342 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP140Q13342 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP140Q13342 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SP140Q13342 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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SP140Q13342 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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SP140Q13342 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SP140Q13342 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SP140Q13342 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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SP140Q13342 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SP140Q13342 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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SP140Q13342 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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SP140Q13342 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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SP140Q13342 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SP140Q13342 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SP140Q13342 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SP140Q13342 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SP140Q13342 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SP140Q13342 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SP140Q13342 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SP140Q13342 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SP140Q13342 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SP140Q13342 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SP140Q13342 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SP140Q13342 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SP140Q13342 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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