Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATMQ13315 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATMQ13315 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATMQ13315 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATMQ13315 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATMQ13315 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATMQ13315 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATMQ13315 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATMQ13315 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATMQ13315 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATMQ13315 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATMQ13315 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATMQ13315 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATMQ13315 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATMQ13315 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATMQ13315 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATMQ13315 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATMQ13315 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATMQ13315 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATMQ13315 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATMQ13315 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATMQ13315 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATMQ13315 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATMQ13315 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATMQ13315 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATMQ13315 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATMQ13315 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATMQ13315 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATMQ13315 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATMQ13315 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATMQ13315 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATMQ13315 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATMQ13315 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATMQ13315 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATMQ13315 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATMQ13315 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATMQ13315 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATMQ13315 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATMQ13315 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATMQ13315 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATMQ13315 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATMQ13315 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATMQ13315 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATMQ13315 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATMQ13315 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATMQ13315 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATMQ13315 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATMQ13315 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATMQ13315 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATMQ13315 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATMQ13315 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATMQ13315 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATMQ13315 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATMQ13315 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATMQ13315 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATMQ13315 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATMQ13315 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATMQ13315 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATMQ13315 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATMQ13315 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATMQ13315 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATMQ13315 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATMQ13315 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATMQ13315 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATMQ13315 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATMQ13315 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATMQ13315 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATMQ13315 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATMQ13315 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATMQ13315 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATMQ13315 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATMQ13315 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATMQ13315 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATMQ13315 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATMQ13315 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATMQ13315 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATMQ13315 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATMQ13315 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATMQ13315 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATMQ13315 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATMQ13315 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATMQ13315 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATMQ13315 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATMQ13315 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATMQ13315 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATMQ13315 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATMQ13315 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATMQ13315 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATMQ13315 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATMQ13315 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATMQ13315 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATMQ13315 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATMQ13315 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATMQ13315 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATMQ13315 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATMQ13315 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATMQ13315 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATMQ13315 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATMQ13315 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATMQ13315 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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