Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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SKP2Q13309 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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SKP2Q13309 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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SKP2Q13309 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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SKP2Q13309 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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SKP2Q13309 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKP2Q13309 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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