Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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CLN3Q13286 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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CLN3Q13286 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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CLN3Q13286 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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CLN3Q13286 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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CLN3Q13286 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN3Q13286 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLN3Q13286 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
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