Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTGDRQ13258 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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