Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP4Q13115 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DUSP4Q13115 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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