Protein–RNA interactions for Protein: Q13094

LCP2, Lymphocyte cytosolic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP2Q13094 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LCP2Q13094 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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