Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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