Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 ZFR-203ENST00000505204 552 ntTSL 411.43□□□□□ -0.587e-9■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 AC004381.2-201ENST00000637768 1329 ntBASIC9.74□□□□□ -0.857e-9■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 SAE1-205ENST00000594144 723 ntTSL 315.02■□□□□ -03e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 SAE1-210ENST00000600706 744 ntTSL 59.59□□□□□ -0.873e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.651e-6■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.061e-6■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.131e-6■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 SLC35E2-203ENST00000475229 1259 ntTSL 311.31□□□□□ -0.61e-6■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 SERINC5-204ENST00000512972 1627 ntTSL 222.86■■□□□ 1.258e-8■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 SERINC5-206ENST00000632581 1573 ntTSL 222.84■■□□□ 1.258e-8■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.248e-8■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 SERINC5-202ENST00000507668 6479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.538e-8■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 SERINC5-205ENST00000513907 547 ntTSL 47.47□□□□□ -1.218e-8■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 UBE2J2-207ENST00000435198 1056 ntTSL 326.21■■□□□ 1.792e-6■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.382e-6■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 UBE2J2-210ENST00000464036 1256 ntTSL 323.3■■□□□ 1.322e-6■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.052e-6■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 UBE2J2-209ENST00000461142 837 ntTSL 321.5■■□□□ 1.032e-6■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 UBE2J2-214ENST00000473215 1028 ntTSL 321.31■■□□□ 12e-6■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 UBE2J2-206ENST00000422076 643 ntTSL 520.8■□□□□ 0.922e-6■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 UBE2J2-219ENST00000503294 814 ntTSL 420.8■□□□□ 0.922e-6■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 UBE2J2-208ENST00000450390 2455 ntTSL 520.59■□□□□ 0.892e-6■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.682e-6■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 UBE2J2-220ENST00000509720 472 ntTSL 318.99■□□□□ 0.632e-6■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 UBE2J2-211ENST00000466752 886 ntTSL 318.75■□□□□ 0.592e-6■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 UBE2J2-217ENST00000491779 611 ntTSL 218.75■□□□□ 0.592e-6■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.452e-6■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.362e-6■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 UBE2J2-218ENST00000502382 530 ntTSL 416.01■□□□□ 0.152e-6■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 UBE2J2-215ENST00000477894 767 ntTSL 515.76■□□□□ 0.112e-6■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 U2AF2-203ENST00000587196 778 ntTSL 314.21□□□□□ -0.134e-8■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 ZBED9-204ENST00000530247 755 ntTSL 211.86□□□□□ -0.517e-9■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.453e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.263e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.173e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 DDT-205ENST00000428792 333 ntTSL 27.44□□□□□ -1.223e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 TNNT1-213ENST00000589226 604 ntTSL 213.52□□□□□ -0.253e-6■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 TNNT1-216ENST00000593046 800 ntTSL 213.52□□□□□ -0.253e-6■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 TNNT1-210ENST00000588147 489 ntTSL 1 (best)13.27□□□□□ -0.293e-6■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 TNNT1-215ENST00000592920 583 ntTSL 513.07□□□□□ -0.323e-6■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.593e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 FAM83H-202ENST00000395103 3611 ntTSL 215.23■□□□□ 0.033e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.634e-9■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.574e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 R3HDM4-205ENST00000589445 705 ntTSL 322.16■■□□□ 1.144e-9■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 R3HDM4-206ENST00000590454 1006 ntTSL 321.09■□□□□ 0.974e-9■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.674e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 UNKL-212ENST00000511095 924 ntTSL 418.99■□□□□ 0.633e-9■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.524e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.54e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.434e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 GSPT1-204ENST00000562169 466 ntTSL 316.92■□□□□ 0.31e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.224e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.174e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 GIPR-204ENST00000588816 709 ntTSL 516.08■□□□□ 0.164e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.024e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 AGO3-207ENST00000634486 3599 ntTSL 514.08□□□□□ -0.164e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 GSPT1-210ENST00000568849 790 ntTSL 314.02□□□□□ -0.174e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.174e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.194e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 BIN3-203ENST00000518366 470 ntTSL 313.87□□□□□ -0.194e-7■□□□□ 9.7
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ILF3Q12906 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.344e-7■□□□□ 9.7
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ILF3Q12906 SRP72-201ENST00000342756 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.761e-15■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 BIN3-207ENST00000520292 775 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.774e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 AC002116.2-201ENST00000586962 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.783e-9■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 GSPT1-201ENST00000420576 1603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.834e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 NUP43-203ENST00000367404 1089 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.844e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 BIN3-211ENST00000522687 659 ntTSL 59.06□□□□□ -0.964e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 PI4KA-205ENST00000466162 589 ntTSL 48.89□□□□□ -0.994e-9■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.154e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 USP48-206ENST00000464577 2089 ntTSL 26.75□□□□□ -1.334e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 ROR2-203ENST00000476440 316 ntTSL 56.12□□□□□ -1.434e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.554e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.64e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 SRP72-204ENST00000507126 2181 ntTSL 1 (best)3.3□□□□□ -1.881e-15■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.517e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 PROC-202ENST00000402125 779 ntTSL 218.14■□□□□ 0.497e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 PROC-209ENST00000464089 563 ntTSL 417.57■□□□□ 0.47e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.077e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.117e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 PSME4-201ENST00000389993 6581 ntTSL 1 (best)14.29□□□□□ -0.127e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.137e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 CEP95-209ENST00000579860 895 ntTSL 514.08□□□□□ -0.167e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 FAM177A1-206ENST00000553955 731 ntTSL 313.6□□□□□ -0.237e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.257e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 SCARB1-209ENST00000545305 851 ntTSL 213.44□□□□□ -0.267e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 CEP95-210ENST00000580188 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 413.34□□□□□ -0.277e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 ADH5-210ENST00000512621 1475 ntTSL 212.2□□□□□ -0.467e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 FAM177A1-201ENST00000280987 2927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.537e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 EXTL2-207ENST00000535414 3146 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.567e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 ADH5-211ENST00000512659 822 ntTSL 510.71□□□□□ -0.697e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 FAM177A1-203ENST00000396472 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.727e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 ADH5-212ENST00000512991 880 ntTSL 510.55□□□□□ -0.727e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 EXTL2-202ENST00000370114 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.797e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 ADH5-204ENST00000503130 786 ntTSL 39.7□□□□□ -0.867e-7■□□□□ 9.7
ILF3Q12906 ADH5-203ENST00000502590 697 ntTSL 59.31□□□□□ -0.927e-7■□□□□ 9.7
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