Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP160Q12769 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
NUP160Q12769 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
NUP160Q12769 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
NUP160Q12769 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NUP160Q12769 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
NUP160Q12769 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC27.58■■■□□ 2
NUP160Q12769 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NUP160Q12769 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NUP160Q12769 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NUP160Q12769 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms