Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBBP4Q09028 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms