Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM27E3Q08E93 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.8 ms