Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPOCK1Q08629 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 373.4 ms