Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PUDPQ08623 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms