Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DDR1Q08345 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms