Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EGR3Q06889 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms