Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABPB1Q06547 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms