Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNG1Q06432 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNG1Q06432 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms