Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms