Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNEQ04844 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms