Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERCC6Q03468 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERCC6Q03468 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms