Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLOD1Q02809 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLOD1Q02809 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms