Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
EXOSC10Q01780 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC10Q01780 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms