Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2F1Q01094 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms