Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSG4Q00888 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms