Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK16Q00536 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK16Q00536 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms