Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKL1Q00532 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKL1Q00532 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKL1Q00532 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKL1Q00532 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKL1Q00532 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKL1Q00532 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKL1Q00532 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKL1Q00532 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKL1Q00532 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKL1Q00532 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKL1Q00532 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKL1Q00532 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKL1Q00532 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKL1Q00532 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKL1Q00532 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKL1Q00532 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKL1Q00532 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKL1Q00532 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKL1Q00532 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKL1Q00532 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKL1Q00532 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDKL1Q00532 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms