Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EFNB1P98172 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EFNB1P98172 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms