Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX1P78337 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX1P78337 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX1P78337 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX1P78337 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX1P78337 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX1P78337 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PITX1P78337 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PITX1P78337 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX1P78337 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX1P78337 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX1P78337 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX1P78337 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX1P78337 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX1P78337 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX1P78337 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX1P78337 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX1P78337 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX1P78337 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX1P78337 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX1P78337 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX1P78337 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX1P78337 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX1P78337 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX1P78337 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX1P78337 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX1P78337 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX1P78337 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX1P78337 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX1P78337 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX1P78337 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX1P78337 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX1P78337 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX1P78337 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX1P78337 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX1P78337 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX1P78337 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX1P78337 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX1P78337 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PITX1P78337 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX1P78337 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX1P78337 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX1P78337 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX1P78337 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX1P78337 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX1P78337 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX1P78337 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX1P78337 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX1P78337 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX1P78337 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX1P78337 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX1P78337 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX1P78337 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PITX1P78337 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms