Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPS4XP62701 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS4XP62701 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms