Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DEFA1P59665 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA1P59665 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms