Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms