Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCLMP48507 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCLMP48507 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCLMP48507 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCLMP48507 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GCLMP48507 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCLMP48507 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCLMP48507 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCLMP48507 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCLMP48507 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCLMP48507 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCLMP48507 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCLMP48507 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCLMP48507 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCLMP48507 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCLMP48507 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCLMP48507 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCLMP48507 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCLMP48507 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCLMP48507 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCLMP48507 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCLMP48507 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCLMP48507 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCLMP48507 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GCLMP48507 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCLMP48507 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCLMP48507 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GCLMP48507 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCLMP48507 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCLMP48507 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCLMP48507 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GCLMP48507 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCLMP48507 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCLMP48507 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCLMP48507 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCLMP48507 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCLMP48507 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCLMP48507 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCLMP48507 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCLMP48507 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCLMP48507 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCLMP48507 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCLMP48507 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCLMP48507 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCLMP48507 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCLMP48507 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCLMP48507 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCLMP48507 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCLMP48507 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GCLMP48507 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GCLMP48507 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCLMP48507 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCLMP48507 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GCLMP48507 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCLMP48507 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GCLMP48507 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCLMP48507 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCLMP48507 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCLMP48507 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCLMP48507 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCLMP48507 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCLMP48507 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCLMP48507 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCLMP48507 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCLMP48507 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCLMP48507 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCLMP48507 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCLMP48507 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCLMP48507 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCLMP48507 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCLMP48507 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCLMP48507 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCLMP48507 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCLMP48507 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GCLMP48507 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCLMP48507 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GCLMP48507 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GCLMP48507 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCLMP48507 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCLMP48507 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCLMP48507 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCLMP48507 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCLMP48507 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCLMP48507 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCLMP48507 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCLMP48507 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCLMP48507 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCLMP48507 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCLMP48507 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCLMP48507 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCLMP48507 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCLMP48507 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCLMP48507 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCLMP48507 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCLMP48507 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
GCLMP48507 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GCLMP48507 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GCLMP48507 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GCLMP48507 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GCLMP48507 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms