Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBRP36941 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBRP36941 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBRP36941 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBRP36941 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBRP36941 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBRP36941 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBRP36941 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBRP36941 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBRP36941 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBRP36941 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBRP36941 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBRP36941 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBRP36941 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBRP36941 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBRP36941 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBRP36941 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBRP36941 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBRP36941 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBRP36941 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBRP36941 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBRP36941 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBRP36941 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBRP36941 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBRP36941 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBRP36941 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBRP36941 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBRP36941 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LTBRP36941 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBRP36941 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBRP36941 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBRP36941 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBRP36941 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBRP36941 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBRP36941 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBRP36941 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBRP36941 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBRP36941 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBRP36941 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBRP36941 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBRP36941 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBRP36941 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBRP36941 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBRP36941 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBRP36941 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBRP36941 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBRP36941 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBRP36941 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBRP36941 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBRP36941 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBRP36941 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LTBRP36941 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBRP36941 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBRP36941 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBRP36941 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBRP36941 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBRP36941 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBRP36941 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBRP36941 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBRP36941 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBRP36941 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBRP36941 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBRP36941 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBRP36941 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBRP36941 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBRP36941 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBRP36941 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBRP36941 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBRP36941 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBRP36941 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBRP36941 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBRP36941 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBRP36941 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBRP36941 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBRP36941 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBRP36941 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBRP36941 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBRP36941 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBRP36941 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBRP36941 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LTBRP36941 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LTBRP36941 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LTBRP36941 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LTBRP36941 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LTBRP36941 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LTBRP36941 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LTBRP36941 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LTBRP36941 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBRP36941 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBRP36941 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBRP36941 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBRP36941 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBRP36941 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBRP36941 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBRP36941 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBRP36941 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBRP36941 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBRP36941 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBRP36941 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LTBRP36941 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms