Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP214P35658 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP214P35658 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP214P35658 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP214P35658 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP214P35658 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP214P35658 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP214P35658 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP214P35658 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP214P35658 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP214P35658 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP214P35658 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP214P35658 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP214P35658 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP214P35658 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP214P35658 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP214P35658 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP214P35658 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP214P35658 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP214P35658 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP214P35658 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP214P35658 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP214P35658 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP214P35658 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP214P35658 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP214P35658 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP214P35658 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP214P35658 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP214P35658 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP214P35658 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP214P35658 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP214P35658 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP214P35658 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP214P35658 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP214P35658 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP214P35658 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP214P35658 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP214P35658 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP214P35658 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP214P35658 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP214P35658 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP214P35658 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP214P35658 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP214P35658 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP214P35658 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP214P35658 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP214P35658 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP214P35658 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP214P35658 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP214P35658 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP214P35658 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP214P35658 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP214P35658 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP214P35658 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP214P35658 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP214P35658 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP214P35658 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP214P35658 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP214P35658 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP214P35658 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP214P35658 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP214P35658 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP214P35658 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP214P35658 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP214P35658 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP214P35658 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP214P35658 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP214P35658 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP214P35658 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP214P35658 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP214P35658 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP214P35658 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP214P35658 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP214P35658 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP214P35658 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP214P35658 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP214P35658 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP214P35658 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP214P35658 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP214P35658 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP214P35658 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP214P35658 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP214P35658 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP214P35658 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP214P35658 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP214P35658 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP214P35658 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP214P35658 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP214P35658 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP214P35658 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP214P35658 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP214P35658 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP214P35658 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP214P35658 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP214P35658 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP214P35658 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP214P35658 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP214P35658 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP214P35658 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP214P35658 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms