Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NTF4P34130 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF4P34130 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF4P34130 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF4P34130 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF4P34130 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF4P34130 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF4P34130 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF4P34130 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF4P34130 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF4P34130 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF4P34130 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF4P34130 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF4P34130 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF4P34130 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF4P34130 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF4P34130 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF4P34130 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF4P34130 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF4P34130 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF4P34130 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF4P34130 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF4P34130 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF4P34130 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF4P34130 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF4P34130 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF4P34130 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF4P34130 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NTF4P34130 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NTF4P34130 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF4P34130 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF4P34130 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF4P34130 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF4P34130 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF4P34130 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF4P34130 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF4P34130 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF4P34130 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF4P34130 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF4P34130 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF4P34130 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF4P34130 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF4P34130 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF4P34130 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF4P34130 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF4P34130 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF4P34130 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF4P34130 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF4P34130 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF4P34130 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF4P34130 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF4P34130 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF4P34130 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF4P34130 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF4P34130 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF4P34130 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF4P34130 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF4P34130 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NTF4P34130 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms