Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA6P31267 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA6P31267 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA6P31267 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA6P31267 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA6P31267 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA6P31267 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA6P31267 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA6P31267 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA6P31267 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA6P31267 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA6P31267 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA6P31267 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA6P31267 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA6P31267 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA6P31267 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA6P31267 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA6P31267 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA6P31267 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA6P31267 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA6P31267 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA6P31267 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA6P31267 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA6P31267 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA6P31267 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA6P31267 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA6P31267 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA6P31267 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA6P31267 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA6P31267 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA6P31267 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA6P31267 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA6P31267 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA6P31267 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA6P31267 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms