Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA10P31260 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA10P31260 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA10P31260 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA10P31260 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA10P31260 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA10P31260 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA10P31260 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA10P31260 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA10P31260 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA10P31260 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA10P31260 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA10P31260 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA10P31260 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA10P31260 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA10P31260 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA10P31260 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA10P31260 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA10P31260 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA10P31260 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA10P31260 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA10P31260 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA10P31260 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXA10P31260 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXA10P31260 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXA10P31260 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXA10P31260 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXA10P31260 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXA10P31260 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXA10P31260 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms