Protein–RNA interactions for Protein: P31249

HOXD3, Homeobox protein Hox-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3P31249 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HOXD3P31249 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXD3P31249 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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