Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms