Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRMP28827 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
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