Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTAFRP25105 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms