Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATP5F1P24539 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms