Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPREP23469 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPREP23469 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPREP23469 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPREP23469 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPREP23469 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPREP23469 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPREP23469 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPREP23469 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPREP23469 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPREP23469 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPREP23469 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPREP23469 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPREP23469 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPREP23469 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPREP23469 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPREP23469 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPREP23469 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPREP23469 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPREP23469 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPREP23469 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPREP23469 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPREP23469 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPREP23469 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPREP23469 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPREP23469 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPREP23469 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPREP23469 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPREP23469 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPREP23469 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPREP23469 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPREP23469 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPREP23469 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPREP23469 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPREP23469 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPREP23469 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPREP23469 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPREP23469 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPREP23469 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PTPREP23469 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPREP23469 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPREP23469 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPREP23469 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPREP23469 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPREP23469 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPREP23469 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPREP23469 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPREP23469 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPREP23469 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPREP23469 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPREP23469 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPREP23469 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPREP23469 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPREP23469 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPREP23469 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPREP23469 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPREP23469 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPREP23469 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPREP23469 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPREP23469 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPREP23469 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPREP23469 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPREP23469 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPREP23469 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPREP23469 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPREP23469 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPREP23469 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPREP23469 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPREP23469 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPREP23469 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPREP23469 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPREP23469 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPREP23469 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPREP23469 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPREP23469 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPREP23469 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPREP23469 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPREP23469 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPREP23469 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPREP23469 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPREP23469 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPREP23469 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPREP23469 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPREP23469 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPREP23469 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPREP23469 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPREP23469 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPREP23469 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPREP23469 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPREP23469 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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