Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGA6P23229 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA6P23229 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms