Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMB1P20618 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms